Un porte-parole de la junte, Zaw Min Tun, a assuré à la télévision publique MRTV que les deux pilotes étaient en contact avec l'armée.
Il a aussi affirmé que le crash était dû à un problème de moteur et qu'il s'était produit pendant un exercice militaire.
L'avion de combat léger s'est écrasé samedi entre les Etats de Kayin et du Kayah, dans l'est du pays, a-t-il ajouté.
Les Forces de défense des nationalités karenni (KNDF) ont de leur côté affirmé avoir abattu l'avion mais n'ont pas précisé comment.
La junte lutte par ailleurs contre une récente offensive menée dans le nord par des groupes ethniques minoritaires, qui a bloqué le crucial commerce transfrontalier avec la Chine et représente le défi militaire le plus sérieux pour les généraux depuis qu'ils ont pris le pouvoir.
Près de 50.000 civils ont été déplacés par les affrontements dans le nord du pays, ont indiqué vendredi les Nations unies.