Les oiseaux affectés sont des cormorans des Bougainville, dénommés cormorans guanay en Amérique du Sud, au plumage noir et blanc.
Des centaines de cadavres ont été ramassés sur les plages de Coquimbo, à environ 400 km au nord de la capitale Santiago, par les fonctionnaires du Service de l'agriculture et de l'élevage (SAG) local équipés de combinaisons de sécurité biologique, à quelques mètres des nombreux hôtels, restaurants et casinos de cette région de villégiature.
Le résultat des analyses, connu vendredi, écarte la grippe aviaire, a déclaré à l'AFP le directeur du SAG de Coquimbo, Jorge Mautz. Mais les causes de l'hécatombe restent pour l'heure inconnues.
Depuis décembre 2022, le Chili est durement frappé par la grippe aviaire, qui a déjà décimé environ 10% de sa population de manchots de Humboldt, une espèce vulnérable, et des milliers d'autres oiseaux.
Un homme de 53 ans est par ailleurs devenu fin mars le premier humain à être contaminé par la maladie dans le pays, et reste à ce jour hospitalisé.