Il n'a pas donné de précisions sur les installations visées, mais indiqué que l'attaque avait fait deux blessés dans les rangs de l'armée ainsi que des dégâts matériels.
Des explosions ont secoué la capitale syrienne à l'aube, selon un correspondant de l'AFP sur place.
L'Observatoire syrien des droits de l'homme (OSDH), une ONG basée au Royaume-Uni, a affirmé que les frappes avaient visé des positions de groupes pro-iraniens au sud de la capitale, ajoutant qu'au moins un des sites avait été détruit.
Israël a notamment frappé deux fois l'aéroport d'Alep, ville du nord du pays où les groupes relevant de l'Iran et de ses alliés ont une grande influence. Un premier raid avait fait trois morts le 7 mars, et le deuxième avait provoqué des dégâts matériels le 22 mars.
Le 19 février, 15 personnes avaient été tuées lors d'une frappe israélienne sur Damas, qui avait visé un quartier abritant le siège de plusieurs services de sécurité, selon l'OSDH qui dispose d'un vaste réseau de sources dans le pays.
Israël commente rarement les frappes au cas par cas, mais dit vouloir empêcher l'Iran de s'implanter à ses portes.