La tempête a déjà causé des dégâts importants, selon des médias locaux, qui ont fait état d'au moins 6 morts et plus de 100 blessés au cours des quatre derniers jours. Certaines régions, dont Tokai, Kanto et Kyushu, ont connu des précipitations record dépassant les 400 millimètres au cours des dernières 48 heures.
L'impact sur les transports a été grave. La compagnie Japan Railway a suspendu ses services Tokaido Shinkansen entre Gifu-Hashima et Maibara ce samedi matin à cause des fortes pluies, selon l'agence de presse Kyodo News, basée à Tokyo. Les services ferroviaires entre Tokyo et Nagoya avaient précédemment été interrompus à cause des intempéries.
Le transport aérien a également été fortement perturbé par le mauvais temps. Les compagnies aériennes All Nippon Airways et Japan Airlines ont annulé ou reprogrammé de nombreux vols à destination et en provenance des aéroports des régions sinistrées par le typhon.
L'agence météorologique a émis des alertes dans la région de Tokai, avertissant qu'elle pourrait subir de nouvelles pluies torrentielles jusqu'à dimanche, alors que le typhon Shanshan continue sa progression. Les habitants sont invités à rester vigilants et à prendre les précautions nécessaires lors du passage de la tempête dans la région.
L'agence météorologique japonaise a signalé que le typhon, qui se déplace en direction de l'est-sud-est à environ 15 kilomètres par heure, se trouvait actuellement à 50 kilomètres au sud du cap Shionomisaki.