Adalet Bakanlığı tarafından hazırlanan Yargıtay ve Danıştay'ın yapısında köklü değişiklikler içeren kanun tasarısında, terör suçlarının soruşturulması ve yargılanmasıyla ilgili düzenleme de yer alıyor. TBMM Başkanlığı'na sunulan Danıştay Kanunu ile Bazı Kanunlarda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun Tasarısı'nın yasalaşmasıyla Terörle Mücadele Kanunu kapsamına giren suçlardan açılacak soruşturmalar, suçun işlendiği yerin bağlı olduğu ilin Cumhuriyet başsavcılığınca yürütülecek.
İl Cumhuriyet savcısı, suçun işlendiği yerin Cumhuriyet savcısından soruşturmanın kısmen veya tamamen yapılmasını isteyebilecek. Gecikmesinde sakınca bulunan hallerde suçun işlendiği yerin Cumhuriyet savcısı zorunlu olan delilleri toplayacak ve gerekmesi halinde alınacak kararlar bakımından bulunduğu yerin Sulh Ceza Hakimliğinden talepte bulunacak.
Bu suçlara ilişkin açılan davalar ise suçun işlendiği yerin bağlı olduğu ilin adıyla anılan ağır cezada görülecek. Bu düzenlemeyle, eylemlerini İstanbul'un birden fazla ağır ceza mahkemesinin yetki alanında gerçekleştiren terör örgütü üyelerinin yargılamaları İstanbul Adliyesi'nde yürütülecek. Ayrıca ağır ceza mahkemesi olan bir ilçede işlenen aynı kapsamdaki suçlar nedeniyle açılacak davalar da o ilçenin bağlı bulunduğu il merkezindeki ağır ceza mahkemesinde görülecek.
Bu düzenleyle birlikte FETÖ ve PKK başta olmak üzere terör örgütlerine ilişkin soruşturma ve kovuşturmaların tek merkezde ve daha tecrübeli kolluk kuvveti ile yargı mensuplarınca yürütülmesi sağlanacak. Düzenlemeden terör olaylarının yaşandığı Nusaybin ve Cizre gibi ilçelerdeki soruşturmalar da etkilenecek. Soruşturmalar Mardin ve Şırnak Cumhuriyet Başsavcılıkları tarafından yürütülecek.