Atalay'ın Başkanlığa gelmesinden sonra Cumhuriyet Gazetesi'ndeki ulusalcı muhabir ve yazarlar birer birer tasfiye edildi. Milliyet Gazetesi'nden Cumhuriyet'e geçen Can Dündar gazetenin Genel Yayın Yönetmeni Utku Çakırözer'den boşalan koltuğa 9 Şubat 2015 tarihinde oturdu. 17-25 Aralık darbe girişimi sonrası açığa alınan savcılar Celal Kara ve Mehmet Yüzgeç gibi isimlerle çok sayıda görüşme yapan Can Dündar, Gazeteyi FETÖ'nün hukuksuz elde ettiği soruşturma dosyalarındaki haberlerle doldurdu. Bardağı taşıran son damla ise 29 Mayıs 2015'te, sürekli olarak FETÖ'cülerin gündeme getirdiği ve bir FETÖ kumpası olduğu mahkemelerce anlaşılan MİT'e ait yardım TIR'larının durdurulması olayına ilişkin gizli kalması gereken bilgi ve fotoğrafların manşetten yayımlanması oldu.
