Hrant Dink'in ölümüyle ilgili hazırlanan iddianamede şüpheli olarak geçen Mülkiye Başmüfettişi Şükrü Yıldız'ın gerçekleştirdiği usulsüzlükler ayrıntılı olarak yer aldı. 30 Ocak 2008 tarihinde Teftiş Kurulu Başkanlığı tarafından soruşturmada başmüfettiş olarak atanan Yıldız'a Trabzon İstihbarat Şube'den Yasin ve Osman Hayal ile ilgili 308 sayfalık klasör verildi. Klasör üzerinden bilirkişiler Durmuş Demirbaş ve Levent Yarımel'in 2 gün inceleme yaptıktan sonra Akyürek'in başında bulunduğu İstihbarat Şube'nin araştırması 12 maddelik talep yazısı gönderdi.
Talep yazısını alan Akyürek'in bilirkişilere istedikleri belgelere 2 gün içinde vereceğini söyledi. Ancak olaydan iki gün sonra Akyürek, Bilirkişi Levent Yarımel'i görüşmek için çağırdı. Akyürek'in bilirkişilerin 12 maddeden oluşan isteklerini elinde tutarak Yarımel'e “Sen ne yapıyorsun, log kayıtlarını, Erhan Tuncel'le buluşma üzerine yapılan F/3, F/4 raporlarını neden istiyorsun bu yazı bizi yakar, yazınızda istediğiniz yönetmelik, yönerge ve talimatlar dışındaki taleplerinizi yerine getirmeyeceğim” dedi. FETÖ'nün çıkarlarına hizmet ettiği tespit edilen Başmüfettiş Şükrü Yıldız'ın ise, “İstanbul'la ilgili rapor hazırlayın. Akyürek ve Trabzon'u karıştırmayın” talimatı ile soruşturmayı engelledi.
