Genelkurmay Başkanlığı, web sayfasında yapılan bazı düzenlemelerin yeniden yapılandırma çalışmaları kapsamında olduğunu belirterek, başka herhangi bir anlam ve amaç taşımadığını bildirdi. Genelkurmay Başkanlığı'nın internet sitesinde yer alan basın açıklamasında, şöyle denildi: "Genelkurmay Başkanlığı web sayfasında yapılan bazı düzenlemelerin basın ve yayın organlarında değişik şekillerde yorumlandığı görülmektedir. Söz konusu düzenlemeler, web sayfasının yeniden yapılandırılması için bir süreden beri yürütülmekte olan bazı teknik çalışmalar olup, başka herhangi bir anlam ve amaç taşımamaktadır. Bu düzenlemeler kapsamında yeni bilgiler konması sonucu, web sayfasından kaldırılan bilgilere arşivden ulaşmak mümkün olacaktır. " Bazı gazetelerde Başbakan Recep Tayyip Erdoğan ve Genelkurmay Başkanı Orgeneral Yaşar Büyükanıt'ın İstanbul'da yaptıkları görüşmenin ardından Genelkurmay internet sitesinden muhtıra niteliğindeki açıklamanın kaldırıldığı haberleri yer almıştı.