Mahkeme tarafından kabul edilen iddianamede Balyozcuların hedefleri detaylı olarak deşifre edildi. İddianameye göre darbecilerin ilk hedeflerinden birisi de Türkçe ezan uygulamasını yeniden başlatmak
Özel Yetkili Cumhuriyet savcıları iddianamede şok iddialara yer verildi. İşte iddianameden bazı satır başları:
Balyoz Harekât planında; kimlerin gözaltına alınacağı, tutuklanacağı, emekliye sevk edileceği, hangi üniversite öğrencilerinin ilişiklerinin kesileceği, hangi kamu görevlilerinin işlerine son verileceği, hangi basın yayın organlarının yayınının durdurulacağının belirlendiği, bu belirlemelerde insanların siyasi, ideolojik ve dini görüşlerine göre, kurumların da benzer şekillerde fişlendikleri belirtildi.
Iddianameye göre, Balyozcular eleman bulma konusunda şu referansların baz alınacağı belirtiliyor: “TSK'nın her kademesine müzahir eleman temini konusunda referans uygulamasına (ÇYDD, ADD, Türkiye Gençlik Birliği vb.) devam edilerek azami koordinasyon sağlanmasına...”
Iddianameye göre Balyoz Planı yapanlar basının da aktif olarak kullanılacağı organizasyon şu şekilde işleyecek: “AKP yönetimi başta olmak üzere tarikat, cemaat ve irticai grup lideri ve önderlerinin tasfiyesi ve işbirlikçilerinin saf dışı bırakılması maksadıyla; ahlaki zafiyeti olanların tespit edilerek, gerekli hazırlıkların yapılacağı, basın vasıtası ile deşifre edilerek malzeme olarak kullanılacağı..”
Planı yapanların sıkıyönetim ilan ettirmek için atacağı adımlar arasında “Sürekli irticai faaliyetler ile ilgili haberler, öğrenci olayları artan şehit cenazeleri, ekonomik bunalım, faili meçhul eylemlerle sokaklara dökülmüş halk temaları sürekli işlenerek, halkın en güvendiği kurum olan TSK'dan gereğini yapmasını beklediği yönünde kamuoyu yönlendirme çalışmalarının yapılacağı” iddia edildi.
İddianameye göre, darbenin hemen sonrasında Türk Silahlı Kuvvetleri'ni yeniden yapılandırmayı, MİT'in başına muvazzaf bir generali getirmeyi düşünen Balyozcular, ezanı yeniden Türkçe'ye döndürme planları yaptıkları ortaya çıktı. İddianamede bu duruma şöyle dikkat çekti: “Cumhuriyetin aşındırılan tüm kazanımlarının tekrar yerleştirileceği, Türkçe ezan dâhil tüm ulusal değerlerin hayata geçirilerek Arap ve Kürt unsurların Türk kültürüne verdikleri zararların telafi edileceği.”
İddianamede, suç işleyenlerin asker olmalarına karşın askeri yargının görevli olmadığına kanaat getirildiği ayrıntılı olarak anlatıldı. Söz konusu darbe planının sonuçlarının yine askeri mahal dışında meydana gelecek nitelikte olması nedeniyle de askeri mahal hükmünün uygulanmasının mümkün olmadığı belirtildi.
İddianamede savcılığa teslim edilen bazı belgelerin gizli olması sebebiyle Askeri Savcılık tarafından istendiği ortaya çıktı. İddianamede bu konu şöyle anlatıldı: "Askeri savcılık dosyadaki bazı gizli belgelerin kendilerine teslimini istemiş, ancak belgeler kararın mahkemeceverilmesi amacıyla dosya konulmuştur.”
Balyoz darbe planının İcra Safhası ile ilgili şu ifadeler yer alıyor: “Ortamın hazırlanması safhasında yeterli seviyeye ulaşıldığında icra safhasına geçileceği, PKK ve El Kaide'nin eş zamanlı büyük eylemler yapacağı ve ardından oluşan kaos nedeniyle sıkıyönetim ilan edileceği.."