Genelkurmay Başkanlığı'ndan yapılan açıklamada, '1'inci Ordu Plan Semineri'nin icrasını müteakip hazırlandığı iddia edilen bir belgeye ilişkin haberin gerçeği yansıtmadığı' bildirildi. Genelkurmay Başkanlığı'nın internet sitesinde yer alan bilgi notunda şunlar kaydedildi: '8 Nisan 2010 günü bir gazetede, 5-7 Mart 2003 tarihleri arasında icra edilen 1'inci Ordu Plan Semineri'nin icrasını müteakip hazırlandığı iddia edilen bir belgeye (incelemeye) ilişkin haber yer almıştır. Söz konusu haber gerçeği yansıtmamaktadır.'
Haberde, 1. Ordu Komutanı Çetin Doğan'ın 2003'deki semineri yönetirken yasal çerçevenin dışına çıktığına dair belgenin altında dönemin Kara Kuvvetleri Kurmay Başkanı Orgeneral İlker Başbuğ'un imzası bulunduğu belirtiliyodu.
Belge'nin İstanbul'da Balyoz soruşturmasını yürüten savcılıkta bulunduğu iddia edilen haberde, Orgeneral Başbuğ, seminerin özel bölümünde, Orgeneral Çetin Doğan'ın oturumu yönetirken, resmi ve yasal çerçevenin dışına çıktığına dair ciddi çekince ve eleştirilerde bulunduğu bilgisi yer alıyordu. Başbuğ'un belgeyi, Aytaç Yalman'ın Kara Kuvvetleri Komutanı, Özkök'ün de Genelkurmay Başkanı olduğu o dönemde “Kara Kuvvetleri Kurmay Başkanı” sıfatıyla durumla ilgili yapılan inceleme ve gelen bilgiler ışığında hazırladığı ileri sürülüyordu.
