Ergenekon'un 3. iddianamesinin 6. ek klasöründe yer alan belgelere göre, savcılar Başkent Üniversitesi Rektörü Mehmet Haberal'ın kalp rahatsızlığı sebebiyle tedavi gördüğü hastaneden 'ivedi' olarak bazı bilgiler istemiş.
Ergenekon tutuklusu Haberal'ın 'hastalığı hakkında konulan teşhis ve buna ilişkin tedavi süresi ile tedavisini yapan doktorların açık kimliklerinin bildirilmesi'ni isteyen savcılar, "aynı mahiyetteki hastalıklar ile ilgili olarak daha önce hastanenizde tedavi görmüş hastalara uygulanan tedavi, yattıkları süre ile buna ilişkin kayıtlardan birkaç tasdikli suretin gönderilmesini" talep etmiş.
Savcıların 2 Haziran 2009'da istediği bilgilere 4 Haziran'da İstanbul Üniversitesi Kardiyoloji Anabilim Dalı Başkan Vekili Prof. Dr. Deniz Güzelsoy cevap göndermiş. Tutuklandığı 17 Nisan 2009'dan bu yana hastanede bulunan Haberal'a tedavi uygulayan doktorların isimlerini de savcıya bildiren Güzelsoy, "Hasta yoğun bakım ünitesinden çıkarıldığında 3. servise alınmıştır.
O tarihten bu yana servis sorumlusu olarak tarafımdan izlenmekte, psikiyatrik kontrol ve tedavileri de Prof. Dr. Kemal Arıkan ve Prof. Dr. Mine Özmen tarafından yapılmaktadır." bilgisini vermiş. Güzelsoy yazısında savcılara bir de uyarı göndermiş: "Haberal'da ciddi kardiyak olay riski olmadığını söyleyip önerilen minimum tedavi süresini dahi tamamlamadan hastaneden çıkarmanın ve yoğun stres yaşayacağı ortama göndermenin sorumluluğunu kendisini izleyen hekimler yanında anabilim dalımızın diğer kardiyologlarının da alamayacağı düşüncesindeyim."
Güzelsoy'un savcıların, 'aynı durumda olan başka hastalara nasıl yaklaşıldığı, nasıl tedavi edildiği ve hastanede ne kadar tutuldukları' şeklindeki sorusuna cevabı ise şöyle: "Bu soruya cevap verecek başka hastalarla ilgili kayıt ve kanıtları arz etmem mümkün değildir. Çünkü yaygın deyişle 'hastalık yoktur, hasta vardır'. Haberal ile birebir aynı hastalıklara, fiziksel ve psikososyal özelliklere sahip hasta bulmak mümkün değildir."