Yasal düzenlemeyle sivillerin askeri mahkemelerde yargılanması ortadan kaldırıldı. Köşk'ün onayını bekleyen düzenleme için muhalefet, anayasaya aykırılık iddiasında bulunurken, hukukçular yeni düzenlemenin değil, mevcut durumunun anayasaya aykırı olduğuna dikkat çekiyor. Anayasa Mahkemesi'nin bu konuyla ilgili değişik tarihlerde kararları bulunuyor. Bunlardan biri 1998 yılında aldığı karar. Söz konusu davada askeri mahkeme bir eri adam öldürmeye tam teşebbüsten yargıladı. Konuyu gündemine alan Anayasa Mahkemesi askeri mahkemenin görev alanını genişlettiğine hükmetti. Kararda şu ifadeler kullanıldı: “Sanık hakkında kamu davasının açılmış olması koşulunun, bir suça 'askeri suç' veya 'benzer askeri suç' niteliği kazandırmayacağı açıktır. Bu nedenle, asker sıfatı sona eren kişinin askeri mahkemede yargılanması sonucunu doğuran itiraz konusu kural, Anayasa'nın 145. maddesine aykırıdır. İptali gerekir.”
