HSYK'daki krizin Başkanvekili Kadir Özbek ile üyelerin yeni anayasa değişikliği yürürlüğe girmeden ve kuruldaki görev süreleri sona ermeden Ergenekon soruşturmasını yürüten savcıların görev yerlerini değiştirmek istemesinden kaynaklandığı belirtiliyor. Yeni anayasa değişikliği paketi yürürlüğe girdikten sonra da kurulun asıl ve yedek üyeleri görevlerini sürdürecekler. Ancak, mevcut üyeler kurulun yeni yapısında etkili olamayacaklarını düşünüyorlar. HSYK'nın yapısının değişmesi halinde üye sayısı 21'e çıkacak. HSYK, geniş tabanlı temsil esasına göre oluşturulacak, 2 veya 3 daire seklinde yapılandırılacak. HSYK'da yargının tümü de temsil edilecek.