FETÖ'nün darbe girişimine ilişkin soruşturma kapsamında tutuklanan dönemin Samsun Garnizon Komutanı Tuğgeneral Mehmet Şükrü Eken'in, 2009-2011 yıllarında Kara Harp Okulunda Öğrenci Alay Komutanı olarak görev yaptığı tarihlerde örgüt üyesi öğrencilerin notlarını yükselttiği ortaya çıktı. FETÖ'nün darbe girişiminde sözde sıkıyönetim listesinin 63. sırasında yer alan ve Samsun-Sinop Sıkıyönetim Komutanı olarak adı geçen Eken hakkında, Cumhuriyet Başsavcıvekili Emrullah İskenderoğlu tarafından hazırlanan iddianame tamamlandı. Eken'in, 'hükümeti devirmeye ve anayasal düzeni cebren ilgaya teşebbüs etmek, terör örgütü üyesi olmak' suçlarından yargılanması istenilen iddianame, Samsun 3. Ağır Ceza Mahkemesi'ne sunuldu. Sanık Eken hakkında talep edilen suçlar kapsamında 3 kez ağırlaştırılmış müebbet ile 10 yıldan 15 yıla kadar hapis cezası isteniyor.
İskenderoğlu'nun ifadesine başvurduğu bir gizli tanık, sözde sıkıyönetim komutanı Eken'in, 2009-2011 yıllarında Kara Harp Okulunda Öğrenci Alay Komutanı olarak görev yaptığını belirtti. Eken okulda komutan iken kendisinin de öğrenci olduğunu kaydeden gizli tanık, “Eken, FETÖ'cü öğrencilerin sınav notlarını yükseltiyor, olmayanların ise notlarını düşürüyordu. FETÖ'cü olmayanlara ağır eğitimler yaptırıp okuldan ayrılmaya zorluyordu” ifadelerini kullandı. Sözkonusu dönemde kara harp okullarındaki FETÖ'cü subaylar, örgütten olmayan öğrencileri 'şok mangaları eğitimi' adı altında işkenceden geçiriyor, TSK'da 'ari yapılanma' hedefine ulaşmak için onların okuldan atılmalarını sağlıyordu.
