Başdağ'ın, Tahşiye grubuna yönelik Turgut Yıldırım'ın 22 Ocak 2010'da el bombası bulunduğu belirtilen ev aramasına katılan polisleri yönlendiren isimlerden olan istihbaratçı komiser Ekrem Öztürk'le o gün yoğun telefon trafiği tespit edildi.
Kumpastan anbean haberdar olduğu ve yönlendirme yaptığı suçlaması yöneltilen Başdağ, savcılık sorgusunun ardından mahkemece tutuklandı. Başdağ, 22 Temmuz 2014'te FETÖ'nün emniyet içerisindeki yapılanmasına yönelik yapılan ilk operasyonda tutuklanarak cezaevine gönderilmişti. Bu sırada kameralar önünde şov yaparak “Haram yemedim” diye bağıran Başdağ, o dönem ifadesinde “Dinlemenin sınırı olmaz, herkes dinlenir” demişti.