CHP’nin Cumhurbaşkanı adayı Muharrem İnce’nin, katıldığı televizyon programında, “Harp Akademileri’ni kapattılar Milli Savunma Üniversitesi kurdular, rektör atadılar o da FETÖ’cü çıktı” açıklamasına tepki gösteren Milli Savunma Üniversitesi Rektörü Erhan Afyoncu, “Milli Savunma Üniversitesi’nde 8 bin civarında personel var; hem asker hem sivil. Teyakkuzdayız; sürekli mücadele ediyoruz. Bir süredir uydurma haberlerle üniversitenin üzerine gidiliyor" dedi.
Milliyet'te yer alan habere göre, üniversiteye iftira atanların 'çamur at izi kalsın' düşüncesiyle hareket ettiğini belirten Afyoncu, "Milli Savunma Üniversitesi’nde rektör, rektör yardımcıları, genel sekreter, dekanlar, harp okulu komutanları... Bu üst düzey yöneticilerden FETÖ’cü çıkmaz” diye konuştu.