Teşkilat ile Flynn arasındaki gerginlik, Flynn'in Rusya büyükelçisiyle yaptığı görüşmelerde diplomatik protokolleri ihlal ettiği yönündeki haberlerin ardından basına yansımıştı.
Politico, durumu yakından bilen iki ayrı kurum görevliasine dayandırdığı haberinde, Flynn'in Ulusal Güvenlik Teşkilatı'ndaki en yakın yardımcılarından biri olan Afrika masası kıdemli yöneticisi Robin Townley'nin CIA'den güvenlik onayı talebinin reddedildiğini bildirdi. Townley'nin Ulusal Güvenlik Konseyi'nde görev yapabilmesi için en üst düzey güvenlik onayı olması gerekiyor.
Politico'nun kaynaklarından biri, talebin red kararının Trump'un atadığı CIA direktörü Mike Pompeo tarafından onaylanmasının da Flynn'i öfkelendirdiğini bildirdi.